Studi di correlazione struttura - attività per composti di interesse farmaceutico

Nell'ambito di collaborazioni con diverse industrie farmaceutiche, sono state determinate le strutture cristalline di vari composti, allo scopo sia di affiancare gli studi per lo sviluppo di nuovi prodotti, sia di completare la caratterizzazione per prodotti già noti. In particolare è proseguito lo studio di tipo QSAR sulle rifamicine, una classe di molecole con importante attività antibiotica. E' stata determinata, mediante diffrattometria a raggi X su cristallo singolo, la struttura cristallina della rifamicina O. E' stata inoltre effettuata un'analisi chemiometrica sui descrittori conformazionali di tutte le rifamicine strutturalmente note per individuare i parametri geometrici responsabili dell'attività antibiotica. I risultati sono stati affiancati da calcoli di meccanica molecolare e di dinamica molecolare volti a chiarire un possibile meccanismo di riarrangiamento conformazionale delle molecole al variare della polarità dell'intorno. Lo studio ha mostrato che la molecola di rifamicina può assumere due conformazioni con differenti caratteristiche di idrofilia. In assenza di ingombri sterici le due conformazioni sono convertibili l'una nell'altra. La conformazione idrofila soddisfa i requisiti per l'attività antibiotica, al contrario della conformazione lipofila. Sulla base di questi dati è stato possibile indurre la cristallizzazione da solventi a bassa polarità di due polimorfi della rifamicina S, caratterizzati mediante diffrazione ai raggi X, che presentano una conformazione lipofila, fino ad ora mai osservata o proposta per le rifamicine attive.

A7. Alessia Bacchi*, Giancarlo Pelizzi, Enrico Redenti, Maurizio Delcanale, Gabriele Amari, and Paolo Ventura, ‘Geneserine Hydrochloride’, Acta Crystallographica, Section C, Vol. C50, (1994), 1126-1130 Pubblicato da Munksgaard, International Booksellers and Publishers Ltd, Copenhagen (Danimarca). ã International Union of Crystallography, 1994.

A10. Enrico Redenti, Maurizio Delcanale, Gabriele Amari, Paolo Ventura, Alessia Bacchi*, and Giancarlo Pelizzi, ‘Solution- and solid-state structures of (-)-N-heptyl-carbamate of geneseroline and its hydrochloride salt’, Journal of Pharmaceutical Sciences, Vol. 84, No. 9, (1995), 1126-1133. Pubblicato dalla American Chemical Society and American Pharmaceutical Association, Washington DC (USA). ã American Chemical Society and American Pharmaceutical Association, 1995.

A12. Alessia Bacchi, Giovanni Mori, Giancarlo Pelizzi, Giorgio Pelosi, Marino Nebuloni, and Gian Battista Panzone, ‘Polymorphism-Structure Relationships of Rifamexil, an Antibiotic Rifamycin Derivative’, Molecular Pharmacology, Vol. 47, (1995), 611-623. Pubblicato da Williams & Wilkins, Baltimore, MD (USA). ã The American Society for Pharmacology and Experimental Therapeutics, 1995.

A27. Enrico Redenti, Margerita Zanol, Gabriele Amari, Paolo Ventura, Giovanni Fronza, Alessia Bacchi*, Giancarlo Pelizzi, 'Structural characterization and solution rotational isomerism of delapril hydrochloride, a dipeptide angiotensin-converting enzyme inhibitor', Il Farmaco, (1998), 53, 214-223. ã Elsevier Science S.A., 1998.

A31. Alessia Bacchi*, Giancarlo Pelizzi, Marino Nebuloni, Pietro Ferrari, 'Comprehensive study on structure-activity relationships of rifamycins: discussion of molecular and crystal structure and spectroscopic and thermochemical properties of rifamycin O', Journal of Medicinal Chemistry, (1998), 41, 2319-2332. Pubblicato da The American Chemical Society, Washington DC, USA ã American Chemical Society, 1998.

A34. Alessia Bacchi, Giancarlo Pelizzi, 'Conformational variety for the ansa-chain of rifamycins: comparison of observed crystal structures and molecular dynamics simulations', Journal of Computer-Aided Molecular Design, 13, 1-12, (1999). In stampa. ã Kluwer Academic Publishers. 1999, The Netherlands.

BO2. A. Bacchi*, G. Pelizzi, ‘Structure-activity relationships of rifamycins: a contribution from X-ray crystallography’, Lepetit Research Center Science Day, Gerenzano, 20 maggio 1996.

BO3. A. Bacchi*, P. Ferrari, M. Nebuloni, G. Pelizzi, ‘Structural studies on Rifamycin O’, XIX Congresso Nazionale ‘Ricerca e Tecnologia’ della Società Chimica Italiana, Riccione, 9-14 giugno 1996.

BO4. A. Bacchi*, G. Pelizzi, P. Ferrari, M. Nebuloni, ‘A critical revision of structure-activity relationships for rifamycins’, XXVI Congresso Nazionale dell’Associzione Italiana di Cristallografia, Alessandria, 1-4 settembre 1996.

BO5. A. Bacchi*, G. Pelizzi, P. Ferrari, M. Nebuloni, 'Solvent memory effects in rifamicyn S polymorphism', XXVIII Congresso Nazionale della Associazione Italiana di Cristallografia, Rimini, 13-16 settembre 1998.